2024-12-30 18:09:01
近日，西北農林科技大學于太永教授課題組聯合國內外多家單位，在豬泛基因與結構變異研究方面取得重要進展。相關成果，以題為“Pangenome and genome variations analysis of pigs unveil genomic facets for its adaptation and agronomic characteristics”的學術論文形式，發(fā)表于國際知名期刊《iMeta》（IF：23.7）。
豬糧安天下。豬肉是我國居民消費的最主要肉類產品，約占我國居民肉類產品消費總量的57.8%。生豬產業(yè)是我國畜牧業(yè)的支柱，其產值約占總量的45.6%。生豬產業(yè)，是實施農業(yè)強國戰(zhàn)略和鄉(xiāng)村振興的重要抓手。我國是養(yǎng)豬大國，但不是養(yǎng)豬強國。生豬養(yǎng)殖科技水平，特別是生豬種業(yè)與國外先進國家相比仍有較大差距。生豬重要經濟性狀形成的調控網絡和遺傳基礎，仍然不明。近年來，高通量測序技術和信息技術迅猛發(fā)展，使得從泛基因組和結構變異角度，解析生豬重要經濟性狀和抗逆性狀形成的機制成為可能。
課題組利用27個中西方豬基因組，構建了迄今為止包含個體數最多的豬圖形泛基因組。在此基礎上，對598個個體的全基因組重測序數據進行結構變異檢測發(fā)現，結構變異與豬的抗逆性和重要經濟性狀的形成密切相關；分析發(fā)現BTF3是調控豬肌內脂肪沉積的關鍵基因。此外，還發(fā)現了與豬耐熱耐寒等抗逆性相關基因，以及調控豬體型大小的關鍵候選基因OPA1。該研究，從泛基因組和結構變異維度加深了人們對生豬重要經濟性狀和抗逆性狀形成機制的理解。同時，也為利用基因組選擇技術加快生豬遺傳改良提供了新的數據基礎和支撐。
豬圖形泛基因組和結構變異分析模式圖
該項研究工作，得到了國家科技重大專項2030（2023ZD04044）、國家重點研發(fā)項目（2021YFD1301200）、陜西省農業(yè)關鍵核心技術攻關項目（2024NYGG006）和陜西省畜禽育種“兩鏈融合”重點專項（2022GD-TSLD-46）等項目的資助。
全文鏈接：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/imt2.257
農業(yè)科技報-中國農科新聞網記者 胡潤田
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